6 сентября 1976 года Зеленогорская 8-летняя школа была реорганизована в Зеленогорскую среднюю школу, рассчитанную на 1320 мест. Первыми учениками стали дети рабочих гидроузла, до этого детей возили на занятия в Крапивино. Занятия проводились в одну смену. Начали учебный год 11 учителей и 73 ученика. Первым директором стал Рассомахин Петр Макарович. Свою должность он занимал до 1978 года. В апреле 2001 года распоряжением администрации Крапивинского района зарегистрировано муниципальное учреждение «Зеленогорская средняя общеобразовательная школа».
В июне 2011 года постановлением администрации Крапивинского муниципального района была проведена реорганизация путем слияния Муниципального общеобразовательного учреждения «Зеленогорская основная общеобразовательная школа» и Муниципального нетипового учреждения «Зеленогорский лицей-интернат» и создания нового юридического лица муниципального бюджетного общеобразовательного учреждения «Зеленогорская средняя общеобразовательная школа».