1 октября 1902 года в городе Мариинске открыта женская гимназия. Мариинская женская прогимназия (неполная гимназия) начала работать в 1902 году. Первоначально она была трехклассной, но потом количество классов увеличили до пяти. Постановлением Мариинской городской думы от 26 мая 1902 года членами попечительного совета прогимназии были утверждены выбранные на трехлетие лица Д.А. Гаврилов, Н.П. Евтин, И.Я. Полуденцев, В.П. Чердынцев, протоирей Иоанн Беневоленский, И.А. Юдалевич, Никандр Степанович Чумаков и А.А. Зеленский. Попечитель Западно-Сибирского учебного округа 8 августа утвердил в звании членов совета всех, кроме И. А. Юдалевича, Беневоленского и Гаврилова. Впоследствии Евтин отказался от обязанностей члена совета, а Чердынцев практически всегда проживал в Томске. В связи с тем что из утвержденных членов совета значительная часть реально не работала, в сентябре 1904 года были проведены новые выборы. На срок по 1 октября 1905 года вместо выбывших были выбраны дополнительно купец П.Т. Савельев, мировой судья К.Е. Стеблин-Каменский, священник Александр Сидонский, мещане Дмитрий Игнатьевич Васильев и Михаил Васильевич Чевелев.
Последний потом отказался от должности. Поскольку 1 октября 1905 года срок деятельности попечительного совета истекал, в августе этого года были проведены новые выборы. На трехлетие по 1 октября 1908 года в состав совета были выбраны уездный исправник А.А. Зеленский, городской врач П.К. Вознесенский, участковый врач П.В. Смирнов, доктор медицины В.Е. Пайсель, надзиратель акцизных сборов Л.Я. Слащев, кандидат прав К.Н. Антонов, дворянин С.С. Улановский, купец И.Я. Полуденцев, помощник городского головы С.Е. Никитин и мещанин Н.П. Евтин.
Строительство здания прогимназии производилось за счет города. Причем в 1903 году, когда в нем уже шли занятия, проводились отделочные работы. На заседании думы 27 июля 1903 года было принято решение передать здание прогимназии в ведение министерства народного просвещения, однако земля под зданием должна была оставаться в собственности города. Решение думы было утверждено губернатором 16 августа того же года. Отныне городские власти снимали с себя обязанности по отоплению, освещению и текущему ремонту здания прогимназии. Однако в сентябре 1903 года попечитель Западно-Сибирского учебного округа отказался принимать здание на баланс министерства. Мотивировал он свой поступок тем, что в помещении еще не были окончены некоторые ремонтные работы. На заседании Мариинской городской думы 27 апреля 1904 года было решено направить в здание прогимназии комиссию в составе гласных думы С.И. Раменского и С.С. Улановского, а также одного из членов городской управы с целью выяснения, какие еще работы необходимо произвести в здании прогимназии. После завершения работ планировалось передать здание в ведение министерства.
Городская комиссия подтвердила, что некоторые работы еще не завершены. Из городских средств были выделены деньги на завершение работ. В течение лета 1904 года удалось устранить все недоработки. В декабре Мариинскую женскую прогимназию посетил попечитель Западно-Сибирского учебного округа. Его удовлетворила проведенная работа, и здание прогимназии было передано на баланс министерства народного просвещения.
Строительство здания прогимназии велось в спешке, поэтому было много недоделок. В первый учебный год (1902/03) ученицы сильно мерзли. Как писали газеты, в здании прогимназии «ветер свободно гулял по комнатам, не раз вылетали целые рамы и к ужасу пешеходов со звоном разбивались о тротуар», «окоченевшие пальцы девочек не держали ручек», «вода просачивалась сквозь потолок, и ее собирали в расставленные ведра и тазы». Городские власти вынуждены были постоянно ремонтировать здание, в том числе и во время проведения занятий.
Вопрос о преобразовании прогимназии в полную гимназию был поднят в 1909 году. Главной проблемой было расширение имеющихся площадей прогимназии. Для обсуждения вопроса в декабре 1909 года было созвано совещание. На нем присутствовали городской голова Иосиф Трифонович Савельев, председатель попечительного совета прогимназии К. Е. Стеблин-Каменский, заступающая место начальника прогимназии А.П. Крылова, делопроизводитель попечительного совета прогимназии Н.И. Леонтьева, председатель педагогического совета И.К. Жилина, инспектор народных училищ 3-го района Томской губернии П.Н. Грязнов и помощник городского головы П.И. Золотарев.
Савельев и Стеблин-Каменский заявили, что деньги на преобразование найдутся. Городской голова предложил план каменной пристройки к существующему зданию прогимназии и смету на реконструкцию на общую сумму около 5 тыс. рублей. Пристройка должна была быть полностью готова в 1911 году. Но преобразование прогимназии в полную гимназию он предложил уже с 1910 года. Пока пристройка еще не сделана, учениц можно было разместить в комнатах, занимаемых начальницей прогимназии. Саму же начальницу временно он предлагал поместить на съемной квартире с оплатой за счет города в 300 рублей в год. Кроме того, городской голова заявил, что при преобразовании прогимназии в гимназию город увеличит финансирование с 2 тыс. рублей до 2,5 тыс. рублей в год. Все предложения Савельева были утверждены на этом совещании.
В мае 1910 года был заключен договор между комиссией, занимающейся перестройкой здания прогимназии, и мещанином Петром Митрофановичем Наумовым. Наумов обязывался к осени 1910 года соорудить все необходимые пристройки согласно плану. Материалы на постройку: камень, кирпич, доски, окна, двери, гвозди и т. д. – заготавливало городское общественное управление. Строитель же с бригадой каменщиков обязан был только выполнить все работы. За каждую кубическую сажень фундамента город платил по 6 рублей, за каждую тысячу уложенного кирпича – тоже 6 рублей.
С 1 июля 1910 года Мариинская женская прогимназия была преобразована в полную гимназию. С начала учебного года был открыт VI класс. Городские власти, как и обещали, стали выплачивать увеличенное пособие в размере 2,5 тыс. рублей. Пристройка окончательно была готова в 1911 году. Летом 1910 года встал вопрос о попечительном совете гимназии. По закону число членов попечительного совета было не определено. Главной обязанностью этого совета являлось пожертвование денежных средств его членов на благо гимназии. В некоторых гимназиях члены совета вносили довольно приличные суммы. Например, в Бийской женской гимназии взносы составляли ежегодно 3,3 тыс. рублей. При Мариинской женской прогимназии также имелся попечительный совет в составе двух постоянных и четырех выборных членов. При преобразовании учебного заведения в полную гимназию было решено переизбрать попечительный совет, увеличив число его членов до семи. В июне 1910 года в его состав были выбраны купцы Иосиф и Петр Трифоновичи Савельевы, дворянин Владимир Стефанский, мещане Владимир Кузьмин, Андрей Улькин, Степан Малков, Дмитрий Васильев. Все были утверждены членами совета на трехлетие – 1910–1912 годы.
В 1913 году губернские власти приняли решение закрыть существовавшие при Мариинской женской гимназии подготовительные классы. В этих классах обучалось 20-30 девочек, которые затем поступали в первый класс гимназии. Поскольку в подготовительных классах детям давались базовые знания, городские власти рассматривали их чуть ли ни как самостоятельное учебное заведение. Аргументы губернских властей были таковы: поскольку при принятии в первый класс гимназии предпочтение отдается тем девочкам, которые прошли подготовительные классы, то соответственно нарушается принцип равноправия при поступлении в гимназию. Из 45–50 мест в первом классе половину занимают дети, проучившиеся в подготовительном классе. По мнению губернских властей, это несправедливо. Городские власти Мариинска не согласились с таким постановлением и выступили с инициативой сохранить подготовительные классы.
Ходатайство Мариинской управы не было удовлетворено. Губернские власти посоветовали открыть вместо подготовительных классов особую образцовую школу, из которой девочки могли бы поступать в гимназию. На открытие такой школы требовалось 1 тыс. рублей в год, но город отказался выделять средства на устройство этой школы. Не складывались взаимоотношения у педагогов гимназии с родителями учениц. На 14 и 15 сентября 1913 года было намечено родительское собрание, но на него никто не явился. Ситуация повторилась почти такая же, как в прошлом, 1912 году. Тогда, правда, удалось собрать родителей, был даже выбран родительский комитет. Но после того, как его председатель Вознесенский отказался от своих обязанностей, комитет перестал существовать.
В 1914 году на гимназию обрушилась другая напасть. Годом ранее в ней было разрешено начать обучение французскому языку с первого класса. Попечительный совет решил, что необходимо ввести обучение французскому языку сразу во всех классах. Когда одна из учениц отказалась изучать этот язык, попечительный совет не разрешил ей этого делать. Весной 1914 года педагогический совет решил устроить экзамен по французскому языку. Это привело в ужас не только учениц гимназии, но и тех девочек, которые только собирались в нее поступать. Никто не скрывал, что уровень подготовки иностранного языка оставляет желать лучшего. Экзамен многие могли провалить, и их пришлось бы исключать из гимназии. В результате попечительный совет обратился в педагогический совет с просьбой отменить экзамен. Педагоги продолжали настаивать на своем, тогда члены попечительного совета направили жалобу в Томск. Многие соглашались с тем, что устраивать экзамен еще рано, обучение языку длилось всего год, да и сами учителя не владели в совершенстве французским.
Сегодня гимназия № 2 - это высокопрофессиональный педагогический состав, 1190 учеников, участие в многочисленных проектах международного и Всероссийского уровня, а также постоянное развитие и движение к новым целям. Школа размещается в трёх зданиях, являющихся памятниками архитектуры. Стены главного здания, построенного в 1902 году, хранят историю, легенды, по его коридорам ходили гимназистки, дамы – интеллигенция, не имевшая возможности вернуться в большой город, но успешно передающая свои знания детям.
Нынешний директор гимназии № 2 Ольга Юрьевна Кукшеева уже десять лет на этом посту.
Здесь работают высоко-профессиональные учителя. Шестнадцать человек из педагогического состава являются выпускниками гимназии разных лет. Многие педагоги принимают участие в конкурсах «Учитель года», «Педагог инновационной школы» и других.
Но главная победа и заслуга учителей, как говорит директор, в том, что они каждый день передают свои знания детям.
Гимназисты регулярно становятся призёрами предметных олимпиад. Кроме того, ребята принимают участие в олимпиаде «Будущие исследователи - будущее науки», «Океан знаний», где они получают не только призовые места, но и дополнительные баллы, дающие льготы при поступлении в высшие учебные заведения.
Из самых свежих побед – Международный конкурс «Инновационные стратегии развития», который оценивало компетентное, профессиональное жюри, в его состав входили преподаватели Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова. Три работы учеников гимназии были признаны лауреатами. Дети получили возможность участвовать в международном торжественном Слёте «Школ юных стратегов Владимира Квинта» в г. Москва.
В гимназии № 2 гордятся и спортивными достижениями. Здесь функционирует школьный спортивный клуб «Юность». Мальчишки и девчонки-футболисты добиваются высоких результатов по мини-футболу, более того, удерживают 3 место в области среди команд, в которых есть даже школы олимпийского резерва. В учебном заведении сильная волейбольная команда.