Решением исполкома организовано управление водоканализационного хозяйства в г. Междуреченске. С этой даты и принято считать начало истории предприятия «Водоканал». Но еще до официального градообразования Междуреченск стал получать воду централизованным способом. В начале 50-х годов прошлого столетия, когда началось строительство шахты «Томусинская 1–2», возник рабочий поселок «Ольжерасс». Для его обслуживания был создан жилищно-коммунальный отдел. Водоснабжение поселка началось в 1952 г. На базе открытого Томского водозабора (в районе турбазы «Восход») и Усинского, расположенного на реке Усе в районе улицы Юдина.
В декабре 1964 г. была сдана в эксплуатацию первая очередь водопроводного узла № 1, в который входил Карайский водозабор. В городе решался вопрос не только с водоснабжением, но и с водоотведением.
Сегодня в состав предприятия МУП «Водоканал» входит 18 структурных подразделений, где трудятся около 500 человек.
Руководит предприятием Братенков Евгений Владимирович.