Штаб МПВО г. Кемерово был преобразован в штаб МПВО Кемеровской области, так началась история Главного управления МЧС России по Кемеровской области.
13 июня 1961 года Постановлением ЦК КПСС, Совета Министров СССР № 639/275 штаб МПВО Кемеровской области переименован в штаб ГО Кемеровской области. Этот день считается днем рождения территориального органа МЧС России.
В соответствии с Указом Президента Российской Федерации № 305 от 18.12.91 г. областной штаб ГО вошел в состав Государственного комитета по делам гражданской обороны и чрезвычайным ситуациям России.
8 мая 1993 года Указом Президента Российской Федерации штаб ГО Кемеровской области переименован в штаб по делам ГО и ЧС Кемеровской области.
1 июля 1997 года в соответствии с Директивой МЧС России (№ 42-26-31 от 6.05.97г.) штаб по делам ГО и ЧС Кемеровской области переформирован в Главное управление по делам гражданской обороны и чрезвычайным ситуациям Кемеровской области. Реформирование проводил полковник Романов Василий Дмитриевич, который стал начальником Главного управления. В 1998 году Главное управление возглавил полковник Мартынов Александр Николаевич, которому в мае 2000 года было присвоено воинское звание генерал-майор.
1 июля 1999 года Главное управление по делам ГО и ЧС Кемеровской области вошло в состав Сибирского регионального центра по делам гражданской обороны, чрезвычайным ситуациям и ликвидации последствий стихийных бедствий.
Указом Президента РФ от 9 ноября 2001 года № 1309 «О совершенствовании государственного управления в области пожарной безопасности» с 1 января 2002 года Управление ГПС Кемеровской области передано в состав Главного управления по делам ГО и ЧС Кемеровской области с сохранением статуса юридического лица.
В соответствии с Указом Президента РФ № 991 от 28 августа, на основании Постановления Правительства РФ № 835 от 23 декабря 2004 года МЧС России переданы функции спасения людей на водных объектах, а ГИМС Кемеровской области стала структурным подразделением Главного управления по делам ГО и ЧС Кемеровской области.
С 1 января 2005 года в Кемеровской области функционирует территориальный орган Министерства Российской Федерации по делам ГО, ЧС и ЛПСБ – Главное управление МЧС России по Кемеровской области, созданный в соответствии Указу Президента РФ №868 от 11 июля 2004 года и Приказу МЧС РФ № 372 от 6 августа 2004 года. С февраля 2005 года по январь 2007 года Главное управление МЧС России по Кемеровской области возглавлял генерал-майор Малый Игорь Александрович.
С января 2007 года Главное управление МЧС России по Кемеровской области возглавляет генерал-майор Арутюнян Ерем Гекторович.