Приказом Минуглепрома СССР в Междуреченске для перевозки угля создана Томусинская автобаза. Автоколонна Осинниковской автобазы стала основой будущего крупнейшего автопредприятия Кузбасса. Под открытым небом базировалось 58 автомобилей. Годовой объем грузоперевозок составлял 600 тысяч тонн угля. Первым директором Томусинской автобазы был назначен Валентин Андреевич Дудиков. Его преемником в 1961 году стал Виктор Иванович Улыбин. Именно ему пришлось крепко ставить на ноги свое новое предприятие, глубоко вникая в имеющиеся проблемы, работая в нескольких направлениях сразу. Именно при Викторе Ивановиче началось масштабное строительство, в том числе городского стадиона «Томусинец».
Уже к своему второму десятилетию автобаза насчитывала 12 автоколонн. Из ее структуры выделились и стали самостоятельными Междуреченская и Сибиргинская автобазы. Быстрому темпу развития автобазы способствовал бурный рост угледобычи на Томусинском руднике.
С 2004-го предприятие осваивает машины – «220 – тонники», внедряет втоматизированную систему диспетчеризации горнотранспортного оборудования, которая позволяет более эффективно организовать работу транспорта на обслуживаемых разрезах.
В 2006 году произошло укрупнение автобазы: к ней присоединились горнотранспортные цеха разрезов «Ольжерасский» и «Сибиргинский». Таким образом, управление стало обслуживать все предприятия открытой добычи угля, входящие в состав ОАО «Южный Кузбасс».
За свою 70-летнюю историю предприятие претерпело не одну реорганизацию, в настоящее время автобаза значится как филиал ОАО «Южный Кузбасс» – «Томусинское автотранспортное управление».
Руководит предприятием сегодня – Братищев Геннадий Федорович.