По приказу народного комиссара угольной промышленности шахта «Физкультурник» (г. Анжеро-Судженск) треста «Анжероуголь» официально была принята в число действующих с проектной мощностью 300 тысяч тонн угля в год. Название шахты связано с Всесоюзным днем физкультурника – его в стране впервые отмечали 10 августа 1939 года, тогда же началась вырубка тайги под будущую шахту.
10 августа 1943 г. Государственной комиссией был подписан акт о сдаче в эксплуатацию шахты «Физкультурник» в Анжеро-Судженске. Это была самая глубокая шахта Кузбасса: добыча угля велась на глубине 600 метров. В этом же году молодое предприятие посетил нарком угольной промышленности В. В. Вахрушев.
В 1949 году была закончена вторая очередь строительства, и мощность шахты была увеличена до 600 тыс. тонн угля в год. В период с 1955 по 1964 годы осуществлена реконструкция шахты. К 1976 году шахта отработала угольные запасы, но, за счет объединения с шахтой «Восход» обрела статус шахтоуправления, новые угольные пласты и вторую жизнь. Шахтоуправление входило в ПО «Северокузбассуголь». В 2004 году, после объединения с шахтоуправлением «Сибирское», появилось новое название – шахтоуправление «Анжерское» в составе угольной компании «Кузбассуголь».
В марте 2008 года собственник компании — группа «Северсталь» — продала её активы транснациональному металлургическому холдингу Arcelor Mittal, точнее его представителю — ОАО «Угольная компания „Северный Кузбасс“». Практически сразу после приобретения у Arcelor Mittal начались проблемы. Начался экономический кризис, спрос на уголь и цены на него резко упали, и весной 2009 года Arcelor Mittal объявил о планах сухой консервации шахты «Первомайская» и шахтоуправления «Анжерское». Но вмешался губернатор Аман Тулеев, предложив безвозмездно передать шахты в областную собственность.
В июле 2010 года предприятие всего за 200 рублей было продано Российской топливной компании (ОАО «Ростоппром») тем самым, ответственность за его судьбу была возложена на государство. В январе 2013 куплено Угольной компанией «Заречная». Одновременно с ш/у «Анжерское» было приобретено ОАО «Анжеро-Судженское погрузочно-транспортное управление», примыкающее к станции Анжерская ЗСЖД ОАО «РЖД». В 2012 году была запущена лава 1 с объемом суточной добычи 3000 тонн. С августа 2014 года в ОАО «Шахтоуправление «Анжерское» введено конкурсное управление с последующим закрытием последней действующей шахты в Анжеро-Судженске – старейшем центре угледобычи в Кузбассе. В 2015 году производство в ОАО «Шахтоуправление «Анжерское» было законсервировано.
Остановка производства и консервация шахты обусловлены необходимостью «оздоровления активов» ООО «Угольная компания «Заречная», в состав которого входит «Анжерское», а также нецелесообразностью внешнего управления на предприятии. Предприятие было закрыто в 2015 году. Работы по ликвидации горных выработок участка «Шахтоуправления «Анжерское» ведутся группой «Сибантрацит». Ликвидируются горные выработки и их вентиляционные каналы, демонтируются наземные сооружения, организуется наблюдение за провалоопасными зонами и уровнем подземных вод на территории шахтоуправления. План работ рассчитан на пять лет — до 2025 года. За это время все 20 горных выработок должны быть ликвидированы. Также «Сибантрацит» взял на себя обязательства по расселению людей из ветхого и аварийного жилья, расположенного в непосредственной близости к участку «Шахтоуправление «Анжерское», до 2030 года.