В Юргинском районе на берегу реки Лебяжьей, основана деревня Филоново, названная по фамилии русских крестьян - переселенцев из Европейской России Филоновых. С 2004 года деревня Филоново входит в состав Проскоковского сельского поселения Юргинского района. До 1917 года деревня Филоново входила в состав Томского уезда Томской губернии (в 72 верстах от Томска), затем принадлежала Тальскому сельсовету Юргинского района.
Миллер в списке деревень Томского уезда в 1734 г. указывает расположение этой деревни на реке Лебяжьей рядом с д. Басалаевой, Н.Ф. Емельянов приводит двойное название этой деревни - Филонова (Асанова).
По ревизии 1811 года в деревне Филоново учтено 10 крестьянских семей, из них 5 семей Филоновых. В 1859 г. 135 жителей, 24 хозяйства, в 1926 г. было учтено 510 жителей и 98 хозяйств, в 1968 г. 301 житель, 99 хозяйств. Была начальная школа, клуб, библиотека, отделение связи, сельсовет, центральная усадьба колхоза им. Кирова.
В настоящее время деревня находится в стадии упадка. Согласно Всероссийской переписи населения 2010 года в деревне проживало 179 человек.
Филоновых. Сегодня в деревне проживает 157 человек.