1659 год

В Юргинском районе на левом берегу реки Томи в 52 верстах от Томска служилыми людьми Томского острога основано деревня Зеледеево как передовой оборонный дозор к югу от крепости. Зеледеево упоминается на карте Ремезова 1701 г. и в списке деревень Миллера, 1734 г. С 1686 г. имела также второе название - село Фроловское.
Деревня Зеледеево считается исторически первым русским поселением на территории современного Юргинского района. Названо оно по фамилии одного из первых жителей заимки Зеледеевой. Известно, что в документах Томского разряда числился в то время некий служилый человек Илюшка Зеледеев (Заледеев). Близость к Томску и Сосновскому острогу, выгодное положение в транспортном отношении по р. Томи, а затем и по Сибирскому тракту, проходившему прямо по населенному пункту, способствовали его быстрому росту. До 1917 года деревня входила в состав Томского уезда. К началу XVIII века в поселении появилась Флоролавровская церковь и оно получило статус села. Церковь является одним из старейших храмов области, она была построена в 1902 году томским купцом Вытновым в честь мучеников Флора и Лавра, покровителей животноводства и строителей. К приходу Фрололавровской церкви относились деревни: Варюхино, Кожевниково, Томилово, Елгино, Мальцево, Макурино.
После закрытия в 1938 году и разграбления в 1940 году храм использовался в качестве помещения для клуба. В 1950-х годах был разобран купол, второй этаж храма и колокольня, а здание было приспособлено под склад. 31 августа 2000 года церковь была передана верующим. 17 ноября 2005 года был освящен крестильный храм в честь святых мучеников Флора и Лавра. С 2007 года при храме действует мужской Православный Реабилитационный центр «Возвращение» для наркозависимых.
В 1670 году в Зеледеево учтено 11 дворов, в 1703 году – 33 двора. По ревизии 1811 года в нем учтено 45 крестьянских семей. В 1926 г. в Зеледеево было учтено 219 хозяйств и 1157 жителей, входила в состав Болотнинского района Новосибирской области. В 1968 г. 534 жителей, 168 хозяйств, восьмилетняя школа, клуб, библиотека, медпункт, отделение связи, сельсовет, центральная усадьба колхоза им. Ульянова.
В 2004 году село Зеледеево становится административным центром Зеледеевского сельского поселения в соответствии с Законом Кемеровской области № 104-ОЗ от 17.12.2004 г. Согласно Всероссийской переписи населения 2010 года в селе проживало 586 человек.