Постановлением Совета Министров РСФСР образован государственный природный заповедник «Кузнецкий Алатау». Он возник на волне шахтерского движения, когда одним из требований стачечного комитета было образование на территории Кемеровской области особого природного режима. Сегодня территория заповедника располагается в Новокузнецком, Междуреченском, Тисульском и Крапивинском районах области. Общая его площадь – 412900 га. Протяженность границ около 400 км.
Создание заповедника в Кемеровской области предлагалось неоднократно в нескольких вариантах. Основным аргументом за создание заповедника выдвигалась проблема сохранения водных ресурсов и биоразнообразия Кемеровской области. Уже после того, как заповедник “Кузнецкий Алатау” был официально создан, Западно-Сибирской экспедицией Главохоты РСФСР проводились лесоустроительные работы с уточнением его границ и его буферной зоны, при этом территория была частично изменена, а площадь сокращена с 455 тыс. га до нынешней (412,9 тыс. га). Таким образом, процесс создания и устройства данного заповедника длился почти десять лет.
Фауна млекопитающих Кузнецкого Алатау включает в себя 65 видов. В том числе: насекомоядные – 11; рукокрылые – 9; грызуны – 24; зайцеобразные – 3; хищные – 13; копытные – 5 видов. Ядро териофауны Кузнецкого Алатау составляют таёжные формы. Это бурозубка крошечная, крупнозубая, бурая, крот алтайский, бурундук, красно-серая полевка и др. Широко представлены также красная и обыкновенная полевка, барсук, выдра, бурый медведь, лисица обыкновенная, волк и лось.
В результате орнитологических исследований хребта Кузнецкий Алатау орнитофауны заповедника, были зарегистрированы 273 вида птиц, из них 209 гнездящихся в Кузнецком Алатау и 194 вида, гнездящихся на территории заповедника. Фауна рыб заповедника состоит из 13 видов.
Особенностью Кузнецкого Алатау может считаться исключительный по высоте для региона снежный покров, достигающий в среднем по территории заповедника 3-5 метров, а в межгорных впадинах и надувах – до 10-15 м.
Заповедник организует туристские конные маршруты по периферии территории, активно ведет эколого-просветительскую деятельность.