Подписано постановление СМ РСФСР №51 "О создании историко-культурого и природного музея заповедника "Томская писаница" управления культуры Кемеровского облисполкома. Это первый в России комплексный музей природы, истории и культуры открытого типа (в н.в. это Государственное автономное учреждение культуры Кемеровской области «Историко-культурный и природный музей-заповедник «Томская Писаница»). В 1995 году музей был отнесен к особо ценным объектам культурного наследия народов Российской Федерации.
Но для того, чтобы такое решение состоялось, потребовались многолетние усилия десятков людей, в разные годы посвятивших свою жизнь изучению и охране всемирно известного памятника первобытного искусства. Сам же историко-археологический заповедник «Томская Писаница» был открыт в 1969 г., когда была определена заповедная зона в 25 га, прилегающая к памятнику наскального искусства Томская Писаница. Этот музей-заповедник с самого начала формировался как органическое соединение трех взаимосвязанных сфер: среда обитания, духовное и историческое наследие.
Во главе музея-заповедника «Томская Писаница» стал профессиональный этнограф, к.и.н. Валерий Макарович Кимеев. В это время были заложены основы функционирования музея: создан профессиональный коллектив единомышленников, утверждены охранные зоны и генеральная схема развития музейного комплекса, проведена топосъемка местности, осуществлен землеотвод, подготовлен и утвержден генеральный план, налажен выпуск рекламной и сувенирной продукции. Были проведены первые комплексные экспедиции по комплектованию фондов и изучению традиционной культуры русского и шорского – коренного населения Притомья, положено начало формированию этнографических экспозиций музея: «Шорский улус Кезек» и «Русское сибирское село». В 1989-91 гг. в результате разведывательных археологических экспедиций вниз по течению Томи сотрудниками музея были обнаружены новые наскальные рисунки.
С 1991 по ноябрь 2004 года музей возглавляла Г.С. Мартынова. Этот период в истории музея-заповедника «Томская Писаница» ознаменован появлением новых экспозиций, организацией научных конференций и семинаров. В 1995 году музеем-заповедником организована международная конференция по проблемам древнего наскального искусства; открыты музей «Петроглифов Азии», являющийся сегодня крупнейшим в России хранилищем коллекций наскального искусства Центральной Азии и археологический комплекс «Археодром».
В 1996-97 гг. созданы экспозиции «Мифология и эпос народов Сибири», Славянский мифологический лес», в 2000 г. экспозиционные комплексы «Время, космос и календари» и «Живая археология». Во второй половине 90-х годов музей-заповедник начинает принимать активное участие в конкурсах и музейных форумах и получает признание в России и за рубежом.
С 2004 г. директор музея-заповедника В.А. Каплунов. В 2005 г. проведена реконструкция музея-заповедника. За 20 лет музей-заповедник превратился в признанный научно-исследовательский центр и настоящую кузницу научных кадров.
Музей-заповедник «Томская Писаница» сегодня – это динамично развивающийся современный многопрофильный культурный комплекс, успешно сочетающий в себе музейную специфику, научную и культурно-просветительскую деятельность. За 30 лет, практически с нуля, он превратился в настоящий музей XXI века и по праву является гордостью Кузбасса. В штате музея сейчас состоят более 60 человек, работающих в разных отделах: фондов, экскурсий и туризма, научно-экспозиционном, реставрации и строительства, административно-хозяйственном. Музей-заповедник «Томская Писаница» - излюбленное место отдыха кузбассовцев и гостей области. Томскую Писаницу посещают находящиеся в Кузбассе с деловыми визитами политики, бизнесмены, представители культуры и науки.
В настоящее время музей-заповедник состоит из следующих экспозиционных зон:
Древнее святилище «Томская Писаница» - памятник истории и культуры народов Евразии. Содержит около 280 наскальных рисунков, датируемых эпохой неолита и бронзы. Это лоси, медведи, антропоморфные изображения, личины, солярные знаки, хищники, птицы и лодки. Самые ранние рисунки относятся к концу неолита к 4-3 тысячелетию до н.э. Вторая большая группа изображений относится к эпохе бронзы, ко II тыс. до н.э. Они расположены на верхнем камне и внизу. Среди них уникальный олень-солнце, танцующие птицелюди, таинственные личины. Очевидно это образы не реальных людей, а духов-предков. Выделяются своей уникальностью фаллические антропоморфные фигуры с птичьими конечностями и головами с клювом. Многие изображения уникальны и относятся к шедеврам первобытного искусства.
Архитектурно-этнографический комплекс «Шорский улус Кезек». Комплекс жилых и хозяйственных построек шорцев конца 19 - начала 20 веков. Отражает традиционную материальную и духовную культуру кузнецких татар, а также влияние культуры и быта русских.
Мифология и эпос народов Сибири. Включает в себя галерею изваяний эпох палеометалла, скифского времени и средневековья; священное дерево, поминальники разных эпох и двух основных природно-исторических зон: северной - таежной и южной - степной.
Археодром. Реконструкции в природной среде древних жилищ народов Сибири эпох бронзы, раннего железного века и средневековья, павильон погребений.
Музей наскального искусства Азии. Представлены наиболее характерные комплексы наскального искусства Сибири, Монголии, Кореи, Китая, Индии и Пакистана.
Славянский мифологический лес. Комплекс дохристианской славянской культуры. Реконструкция языческого капища, копий идолов основных славянских богов.
Экспозиция естественной истории: показ материалов исторической геологии Кузбасса.
Время и календари: комплекс, демонстрирующий единство: космос- природа- время- человек- календарь.
«Монгольская юрта» - отражает условия кочевого образа жизни монгольских скотоводов.
Музей естественной истории - открытый показ материалов по исторической геологии, минералогии, палеонтологии.
Часовня в честь Святых равноапостольных Кирилла и Мефодия - действующая часовня-храм, построенная по канонам древнерусского зодчества из лучших сортов дерева (сосна и лиственница) на живописном берегу р. Томи.
Строится экспозиция: «Русское сибирское село» (жилые и хозяйственные постройки - памятники архитектуры конца XIX - нач. XX вв., трактир, сельская церковь).
Природа заповедника 156 га лесопарковой зоны: 90% - сосновый бор, береговой лес и степные сообщества (400 видов высших растений, из них 5 реликтов). Фауна: крупные млекопитающие, грызуны, 150 видов птиц, 50 видов бабочек. Действует мини-зоопарк.
В музее проводятся фольклорные и религиозные праздники: Рождество, Масленица, Пасха, Троица, Иван Купала, Спас и др.