Кемеровский филиал Новосибирского аграрного университета обрел полную самостоятельность и получил название – Кемеровский государственный сельскохозяйственный институт.
На основании распоряжения правительства РФ от 20.05.2002 г. №663-Р и приказа Министерства сельского хозяйства РФ от 29.05.2002 г. №517 на базе Кемеровского сельскохозяйственного института, выделяемого из состава Новосибирского государственного аграрного университета, создано федеральное государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Кемеровский государственный сельскохозяйственный институт» (ФГОУ ВПО «Кемеровский ГСХИ»).
В соответствии с приказом Министерства сельского хозяйства Российской Федерации от 23.05.2011 г. №132 «О переименовании ФГОУ ВПО и их филиалов» федеральное государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Кемеровский государственный сельскохозяйственный институт» (ФГОУ ВПО «Кемеровский ГСХИ») с 01.08.2011 г. переименован в федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Кемеровский государственный сельскохозяйственный институт» (ФГБОУ ВПО «Кемеровский ГСХИ») (приказ по институту от 01.08.2011 г. №145-О).